Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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