Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms