Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAD51Q06609 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAD51Q06609 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms