Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 BMS1P12-201ENST00000428213 706 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC006042.1-201ENST00000449931 524 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC006064.1-201ENST00000499202 560 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 C3orf52-204ENST00000480282 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms