Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms