Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP7AQ04656 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms