Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDR2Q01850 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDR2Q01850 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms