Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms