Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK3Q00526 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms