Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms