Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms