Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNTAP49354 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNTAP49354 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNTAP49354 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms