Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms