Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DUSP1P28562 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms