Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VARSP26640 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VARSP26640 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms