Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO2P25791 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMO2P25791 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMO2P25791 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms