Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRGP23470 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRGP23470 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
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