Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBTFP17480 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBTFP17480 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBTFP17480 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBTFP17480 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBTFP17480 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBTFP17480 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBTFP17480 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBTFP17480 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBTFP17480 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms