Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TPRP12270 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRP12270 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRP12270 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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