Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms