Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC166P0CW27 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms