Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTSLP07711 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms