Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAK4O96013 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAK4O96013 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAK4O96013 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms