Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POP4O95707 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POP4O95707 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POP4O95707 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms