Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CCNDBP1O95273 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCNDBP1O95273 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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