Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIOO75962 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIOO75962 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIOO75962 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms