Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKAP2O75563 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms