Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTDSP2O14595 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms