Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRTO14522 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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