Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PCH4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
E9PCH4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
E9PCH4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PCH4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PCH4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PCH4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms