Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DGG1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DGG1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4DGG1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms