Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms