Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGAP5A6NIR3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGAP5A6NIR3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms