Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED16Q9Y2X0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms