Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms