Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms