Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C11orf49Q9H6J7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms