Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDGFDQ9GZP0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms