Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms