Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms