Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms