Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms