Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms