Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCT8L2Q96SF2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT8L2Q96SF2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms