Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms