Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIRT1Q96EB6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SIRT1Q96EB6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms