Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms