Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM41Q8WV44 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM41Q8WV44 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms