Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC12Q8WUD4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms