Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms